مهم ترین گزینه در اقتصادی کردن تولید جلبک ها، انتخاب سیستم کشت است. انتخاب سیستم های باز یا بسته، عمودی یا افقی، کشت در فضای آزاد یا گلخانه ای نیز خود به نوع جلبک و هدف گذاری کاربری بستگی دارند. کشت برای مقاصد انسانی لاجرم ما را به سمت سیستم های بسته و تحت کنترل هدایت می کند. لذا با توجه به نوع سیستم مذکور، تولید گران قیمتی را انتظار داریم.
در مواردی که کشت برای مصارف حیوانی، کود، سوخت زیستی و... هدف گذاری شده، سیستم های باز و ارزان قیمت را شاهد هستیم. هرچند کشت در این سیستم ها علاوه بر آلودگی جانبی، راندمان پایینی نیز دارد.
چه معیارهای دیگری را برای کشت ارزان باید در نظر داشت؟